由于石油等传统能源产量无法满足日益增长的能源消费需求，印尼近年来开始大力开发生物能源、地热资源等清洁能源，计划建成“清洁能源大国”，最近还宣布将通过强制性法规支持其发展。印尼政府计划逐步提高生物燃油消费比率，力争在2025年使这一数字达到25％的水平。
印尼出口商联合会秘书长迪甘托罗近日表示，印尼拥有全球40%的地热资源，而且盛产棕榈与蓖麻等可制造清洁能源的原料作物，政府若能妥善管理，必可充分发展这些能源，使印尼成为生产可再生洁净能源的大国。印尼政府鼓励企业生产棕榈油和蓖麻油，并把这两种产业用作可再生的清洁能源产业，给予津贴等加以鼓励。为了满足生物燃料产能增加的需求，印尼最近几年大力开发生物燃料植物园，目前耕种面积已达102.4万公顷。预计到2010年末，印尼用于生物能源生产的油榈棕种植面积将达到约346万公顷。
印尼多家大型私人财团和国营种植园有着悠久的种植经济作物传统，目前它们都在苏门答腊岛、加里曼丹岛和巴布亚等人烟稀少的地区“圈地”开发生物能源产业，并极力争取政府支持。此外，日、韩及中东一些国家的大企业也纷纷筹划在印尼建生物燃料基地。在生物燃料技术方面，印尼已与澳大利亚、美国、日本等国家建立广泛合作。去年巴西总统卢拉访问印尼期间，巴印两国还签署了有关生物乙醇技术合作的协议，双方承诺将加强生物能源领域的合作。
除生物能源外，印尼另一个具有巨大优势的新能源为地热资源。资料显示，印尼地热能源发电量可达2700万千瓦，占全球地热资源的40％，不过印尼已开发的地热发电量只有99.2万千瓦，在印尼全国能源比例中的比重不足4％。由于多种原因，现阶段印尼地热能源开发和利用率十分有限。
2002年后，印尼政府将开发地热资源的权力从国家石油公司划转至能源和矿产资源部，由能源和矿产资源部向境内外投资商颁发开发许可证。目前，印尼准备投资6亿美元，在北苏门答腊省建设全球最大的地热发电站，其总发电能力约为33万千瓦。而10余家外国企业也等着开发印尼地热能源的机会。印尼政府计划，到2020年全国地热发电将达到600万千瓦。
