“十二五”期间，我国磷复肥行业将着重控制总量，提高中低品位磷矿利用率，提高技术创新能力，与农业产业结构调整相适应，以期实现磷复肥行业与农业生产需要协调发展。
磷复肥工业明确了六大发展方向：一是与农业产业结构调整相适应，生产适应农业需求变化的肥料。二是通过技术创新、产业结构和企业结构调整，使整个行业跨上一个新台阶。三是控制总量，淘汰落后产能。四是发展循环经济，实行清洁生产。五是培育、发展品牌产品，提高行业整体水平。六是通过重组、兼并、联合等多种方式组建集团，提高行业集中度，提高企业实力和抗风险能力。
确定了五大发展目标：到2015年，新增能力控制在250万吨，同时淘汰100万吨能力；行业前十家企业产量占总产量的60%，配套磷酸产能的企业由约90家减少到50家左右；企业在研发方面的投入要达到销售收入的3%左右，其他化工品的销售收入占总销售收入的10%；湿法磷酸净化替代热法磷酸150万吨；全行业磷石膏的利用率要达到年产生量的40%。
为了达到上述目标，“十二五”期间将采取以下措施：
控制磷复肥总量，防止盲目发展。不鼓励发展二铵、一铵、重钙、硝酸磷肥、以磷酸为原料生产的复合肥。过磷酸钙、钙镁磷肥不宜再扩大规模。
3～5年内不宜再新建或改扩建湿法磷酸及配套磷复肥项目。引导基础性高浓度磷复肥继续向磷、硫资源产地集中；引导掺混肥、专用肥等二次加工肥料向消费地区转移；鼓励中小型磷肥企业向肥料二次加工、专用肥、配方肥转移；对管理水平差、环境污染严重、缺乏竞争力的企业，引导其转产、改产或关闭破产。
提高中低品位磷矿利用率。继续推动中低品位磷矿特别是胶磷矿精选富集技术的研究，鼓励磷矿综合利用；加大矿山的勘探开发力度及胶磷矿选矿技术的投入，加快中低品位磷矿选矿的产业化；推动硫铁矿选矿技术的研究，提高硫铁矿入炉品位。
通过优化资源配置、兼并、重组、联合等手段提高产业集中度。有资源优势的磷肥企业按产业链整合生产要素，对其他现有企业实行兼并、重组、联合，实现优势互补和资源共享。
提高技术创新能力。加快专用肥、功能肥及节水型肥料的开发和生产；积极开发利用品位较低、杂质含量较高的磷矿生产高浓度磷复肥的工艺技术；研发利用中低品位磷矿直接生产磷复肥新产品，以及使磷、钾矿中的难溶性成分变为易于植物吸收的技术研究；继续做好引进技术、设备的消化、吸收、创新及国产化工作；在大型湿法磷酸生产企业中推广湿法磷酸净化技术，推进磷系阻燃剂及应用于饲料、塑料、水处理剂等行业的磷制品的研究和应用；搞好氟、硅、碘等磷矿伴生资源的回收；鼓励发展缓控释肥料及各种专用肥料。
加快标准体系建设，建立并完善从原料、产品、能耗到排放的完整标准体系，并提高复混肥料行业准入门槛。
积极开展资源的综合利用，实行清洁生产，提高对“三废”特别是磷石膏的综合利用程度。
提升对外开放水平，实施走出去战略，到其他国家开发磷化工、磷肥产品。
四点建议：一是加快市场化进程。在保障国内化肥供应的前提下，应适当放开对化肥的管理，逐步取消现行优惠政策，增加给农民的直补。二是鼓励国内回收硫资源，鼓励企业勘探、开发国内外磷、硫、钾资源；支持鼓励大型国有矿山企业找矿探矿，发掘新的磷矿资源；同时，鼓励大型企业在海外兴办磷、硫、钾资源产业，以促进我国磷复肥工业的可持续发展。 三是进一步完善化肥市场调控体系。针对化肥全年生产、季节消费的特点，在保障国内供应的前提下，取消化肥出口关税限制，在巩固化肥淡季商业储备制度的基础上，逐步建立国家化肥储备体系。四是加大技术研发的资金支持力度。
