独山子石化公司多年来坚持大力推行清洁生产，发展循环经济，在降低能耗、节约资源、保护环境等方面走出了能源与环境和谐统一的发展之路，带动和促进了区域经济社会发展，并获得了首批“国家环境友好企业”称号。
作为国家大型现代炼化生产企业，独石化公司认真落实环保目标责任制，有效运行环境管理体系，提高环保管理水平。早在2000年，公司就在同行业率先建立并通过了ISO14001环境管理体系认证，实现了环境管理与国际接轨。2002年，又建立完善了企业QHSE管理体系，使环保管理形成了环境因素识别评价及控制的良性运行机制。
2004年以来，公司为加强对污染源的控制，投入300多万元增加了废水废气在线监测设施，全面实现了主要污染物排放口在线监测目标。公司持续开展清洁生产装置审核工作，并将其列入“环保目标责任书”进行考核，累计有25套生产装置开展了清洁生产审核，6套生产装置获得行业清洁生产示范装置称号，加氢裂化、催化、裂解等装置共实施清洁生产方案285项，年创经济效益7000万元。
为增强污染治理能力，2004年以来公司共投资10109万元，重点进行了硫磺回收扩能改造，硫磺年回收能力由3000吨提高至5000吨以上，有效控制了因大炼油工程建设过渡期加工高含硫哈油带来的二氧化硫排放问题,还运用先进技术实施二催化汽油脱硫醇改造，汽油碱渣量减少60％以上。
目前，公司拥有废水、废气、废渣及综合利用环保设施77座，“三废”及噪音已全面达标排放，废渣处理处置利用率100％，饮用水清洁，大气环境质量处于优良水平，全面完成了污染物达标排放并减排COD的目标，顺利通过了国家环境友好企业复审。
对正在建设中的千万吨炼油百万吨乙烯工程，公司严格按照“五个一流”标准进行建设，环保投资约15亿元，主要是新建包括污水处理厂及回用措施、炼油系统清洁的加氢工艺、硫磺回收装置及酸性水处理装置、锅炉、循环流化床及布袋除尘工艺以及废碱氧化系统、危废渣场及焚烧装置等。
